А надо ли делать отдельную папку мода
типа этого
.\Crysis\mods\MYMOD\Bin32 ..\Crysis\mods\MYMOD\Code
..\Crysis\mods\MYMOD\Game
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Animations
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Localized
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Objects
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Scripts
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Shaders
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Sounds
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Textures
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Libs
..\Crysis\mods\MYMOD\Game\Materials